Red Bull Racing車手Mark Webber在馬來西亞GP第二段自由練習中持續稱霸，把上午的最快成績門檻再提升到1分36.847秒，不過領先的優勢已不似上午那樣誇張。緊跟在後的是兩位McLaren車手Jenson Button與Lewis Hamilton，以及澳洲人的隊友Sebastian Vettel，前四名之間的差距僅僅只有0.214秒，Button甚至只落後Webber極少的0.005秒，非常地接近。Michael Schumacher則是從碎石堆中倖存下來，他在第六個彎道衝去"鋤草"，並且取得第五快的成績，領先在Ferrari的Felipe Massa之前。另一位Mercedes GP車手Nico Rosberg跑出了第七，接著是Renault的Nick Heidfeld，他彌補了不少上午因故障而損失的圈數，並且位居第八。

Fernando Alonso則是跑出跟第一階段自由練習相同的第九，Jaime Alguersuari居第十。除了Pastor Maldonado在Pit入口右邊的輪子押上草皮，撞壞了他的Williams賽車之外，第二段自由練習可說是相當平靜，這對委內瑞拉人來說相當可惜，因為他今天的速度看起來還算不錯，但其實他也只不過比自己的隊友Rubens Barrichello稍快，兩人分居第11、12。最後30分鐘是賽段的高潮，各車隊開始以高油載搭配軟胎進行測試，企圖了解輪胎退化的速度。這種狀態的單圈時間大約曼最快成績約8秒，差不多是1分44秒左右，而Webber在這樣的模擬中依舊是最快。

馬來西亞GP自由練習二成績

名次 車手 車隊 成績 圈數
1. Mark Webber Red Bull-Renault 1m36.876s 24
2. Jenson Button McLaren-Mercedes 1m36.881s + 0.005 30
3. Lewis Hamilton McLaren-Mercedes 1m37.010s + 0.134 23
4. Sebastian Vettel Red Bull-Renault 1m37.090s + 0.214 30
5. Michael Schumacher Mercedes 1m38.088s + 1.212 26
6. Felipe Massa Ferrari 1m38.089s + 1.213 31
7. Nico Rosberg Mercedes 1m38.565s + 1.689 25
8. Nick Heidfeld Renault 1m38.570s + 1.694 16
9. Fernando Alonso Ferrari 1m38.583s + 1.707 27
10. Jaime Alguersuari Toro Rosso-Ferrari 1m38.846s + 1.970 31
11. Pastor Maldonado Williams-Cosworth 1m38.968s + 2.092 25
12. Rubens Barrichello Williams-Cosworth 1m39.187s + 2.311 30
13. Vitaly Petrov Renault 1m39.267s + 2.391 17
14. Kamui Kobayashi Sauber-Ferrari 1m39.398s + 2.522 29
15. Sergio Perez Sauber-Ferrari 1m39.603s + 2.727 34
16. Paul di Resta Force India-Mercedes 1m39.625s + 2.749 31
17. Adrian Sutil Force India-Mercedes 1m39.809s + 2.933 28
18. Sebastien Buemi Toro Rosso-Ferrari 1m40.115s + 3.239 31
19. Timo Glock Virgin-Cosworth 1m40.866s + 3.990 24
20. Jarno Trulli Lotus-Renault 1m41.890s + 5.014 19
21. Narain Karthikeyan HRT-Cosworth 1m43.197s + 6.321 15
22. Tonio Liuzzi HRT-Cosworth 1m43.991s + 7.115 14
23. Heikki Kovalainen Lotus-Renault 1m44.886s + 8.010 4